Полезные ссылки
  /  Научно-исследовательская деятельность  /  Российский консорциум по секвенированию SARS-CoV-2 

Российский консорциум по секвенированию геномов коронавирусов SARS-CoV-2 (Coronavirus Russian Genetic Initiative, CoRGI)

В настоящее время человечество столкнулось с одним из серьезнейших вызовов новейшего времени — пандемией коронавирусной инфекции COVID-19, вызванной вирусом SARS-CoV-2. Этот вирус был впервые выявлен в провинции Хубэй (КНР) в конце декабря 2019 г. у пациентов с пневмонией неясной этиологии. Несмотря на беспрецедентные меры по сдерживанию распространения нового коронавируса, 11 марта 2020 г. ВОЗ официально объявила о начале пандемии COVID-19.

Одной из важнейших задач в условиях пандемии является генетический анализ циркулирующих вирусов SARS-CoV-2. Полногеномное секвенирование вирусов и публикация полученных данных критически важна для оценки работоспособности используемых ПЦР-тест-систем, отслеживания путей распространения вируса, определения его генетической изменчивости и работы по созданию вакцин. Крупнейшей международной платформой обмена данными генетического анализа SARS-CoV-2 является база данных GISAID.

Первый полный геном вируса SARS-CoV-2 от пациента из России был секвенирован c использованием технологии Oxford Nanopore и выложен в EpiCoV GISAID 18 марта 2020 г. сотрудниками ФГБУ «НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России. В настоящее время в нашей стране регистрируется экспоненциальный рост количества зарегистрированных случаев COVID-19. Опыт Италии демонстрирует, что с увеличением количества случаев заболевания и нагрузки на вирусологические лаборатории темпы генетических исследований вирусов могут существенно снизиться.

ФГБУ «НИИ гриппа им. А. А. Смородинцева» Минздрава России приглашает к сотрудничеству:

  • Лаборатории и ресурсные центры, располагающие возможностями для проведения NGS секвенирования (реагенты для создания библиотек, реагенты и оборудование для проведения секвенирования NGS);
  • Дата-центры для хранения и обработки данных полногеномного секвенирования;
  • Биоинформатиков для анализа полученных данных;
  • Транспортные и логистические компании для организации обмена неинфекционными материалами  между лабораториями.

Цели проекта:

  1. Секвенирование максимально большого количества полных геномов вирусов SARS-CoV-2 от пациентов с COVID-19 из России;
  2. Своевременный анализ и депонирование генетических данных SARS-CoV-2 в базу данных GISAID, используемую мировым научным сообществом и ВОЗ в том числе для разработки вакцин и противовирусных препаратов;
  3. Исследование филогеографии и филодинамики SARS-CoV-2 в России и мире;
  4. Исследование квазивидового разнообразия вирусов SARS-CoV-2 у пациентов c COVID-19.

Что вы получите от участия в проекте?

  • вы сможете принять участие в борьбе с пандемией, даже не являясь вирусологической лабораторией;
  • стать соавтором в публикациях по итогам проекта.

Как стать участником?

Если Вы желаете стать участником, приглашаем Вас пройти краткий опрос. На текущем этапе проект не имеет источника финансирования. Подразумевается самофинансирование участников проекта.

 

 
Референс-центр по диагностике гриппа и ОРВИ
Референс-центр по диагностике гриппа и ОРВИ